论文回看 Microbial community coalescence: does it matter in the Three Gorges Reservoir?

微生物群落融合:它在三峡库区重要吗?

文章简介

本文通过研究三峡库区中不同分层的水、底质中的微生物群落,研究了微生物群落融合这一个最近越来越受重视的内容。通过对比表层水、中层水、底层水和底质中微生物群落的异同,本文通过多种计算方法(包括量化共有物种、微生物溯源、群落cohesion计算)发现群落相同介质中融合程度更高,而在不同介质中融合程度更低。此外,本文也讨论了可能的影响因子,并且发现了不同介质中关键微生物物种的空间分布的线性规律

回看感受

这篇文章后面被不少人询问,我作为作者也能感觉到大家的好奇和认可。不仅有中科院某所的学者发邮件问我相关的计算问题,也有在面试过程中认识的博士生看到我名字就提到这篇文章,说这个内容很新。但这篇文章其实是受到不少限制的产物。首先,样品的理化数据由于第三方的原因缺失,所以不能研究环境响应这部分内容了,我只能掉头去找更好的角度。其次,读到群落融合的时候,恰好相关的水环境中的研究不是很多,所以算是抢到了一点先机。再加上自己之前读 ISME 学到了 cohesion 这个和生态紧密相关的算法,思路上还和群落融合过程有关系,于是我就结合在了一起,在这篇论文中把水和底质数据一起分析。这个做法,在之前我鲜有读过。我猜,审稿人就算想要参考之前的研究提一些问题,也会和我写本文的讨论时一样犯难。这篇文章在写作的时候,我能感觉到在写一种比较新的角度,和以往的有参考的做法不太一样,既有担忧,怕写得偏了,又有好奇,想看看到底最后能否发表、是否受到关注。现在看来,这个研究还算是有个好的结果。

如果用做饭打比方,我觉得这篇是在家里没有盐的情况下,看到冰箱里有酸奶,于是把原本要炒的蔬菜上浇了酸奶,端到桌上拌成了沙拉。

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